D’ençà de la publicació del Reial decret 3/1995 del 13 de gener, publicat al B.O.E. del 4 de febrer de 1995, amb el reconeixement dels efectes civils de les titulacions eclesiàstiques, s’ha produït un canvi de consideració d'aquests estudis pel que fa al seu status legal al mateix temps que s’ha anat generant també, per raons sociològiques i històriques, un canvi de mentalitat respecte als prejudicis que despertava l’estudi de la teologia.

A partir d’aquest moment s’han anat assajant diverses activitats acadèmiques relacionades amb la universitat pública per tal de normalitzar-ne la seva docència:

• En el si dels mateixos campus universitaris, en particular a la Universitat Autònoma de Barcelona i a la Universitat de Barcelona, i a més de les classes de teologia impartides a les Escoles Universitàries de Magisteri des dels anys 80, s’han ofert una vintena de cursos de lliure elecció en matèria teològica organitzats a través del SAFOR (Servei d’Assistència i Formació Religiosa) amb el suport de les institucions docents de la diòcesi. (Un total de 500 hores de docència impartides a uns 400 alumnes)

• En el si de les diverses institucions docents, fundacions i altres entitats, a través de convenis de convalidació de cursos propis reconeguts per les universitats com a crèdits de lliure elecció. (Aproximadament uns 150 alumnes per curs acadèmic sumant tota l’oferta)

Ø       El STU doncs, no parteix de zero, sinó que enfonsa les seves arrels en l’activitat docent duta a terme d’ença que les titulacions eclesiàstiques van ser reconegudes a efectes civils oficialment pel govern espanyol l’any 1995 a través de la secció acadèmica del SAFOR (Servei d’Assistència i Formació Religiosa a les Universitats), depenent de la Delegació diocesana de Pastoral Universitària i amb qui l’UAB te establert un conveni des de l’any 1989 com a servei propi de la universitat.

Ø      L’any 2001 l’UAB demana signar un conveni de col·laboració per a delegar en el nou organisme del STU, la presencia conjunta de les activitats reconegudes com a lliure elecció de totes les institucions que tenien signat conveni amb ella per oferir cursos en les seves respectives seus i alhora obre la porta a organitzar conjuntament activitats acadèmiques en el seu campus. L’acord es signa el dia 15 d’abril del 2002.

D’altra banda la UB i el SAFOR tenen un conveni signat des del 1988 en base al qual s’han anat oferint diverses activitats pastorals i acadèmiques, mitjançant assignatures de lliure elecció, en els mateixos campus de la UB. Després de diverses negociacions i fruit de la constitució del Secretariat, la UB signa un nou conveni amb el STU per al reconeixement de crèdits de lliure elecció de les activitats que aquest organitza al juny del 2004